RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	NCE103	P53615	221 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	DYN3	Q04949	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	GIC2	Q06648	383 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	SIR4	P11978	1358 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	CDC16	P09798	840 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	TSR4	P25040	408 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	MRE11	P32829	692 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RSM22	P36056	628 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	SPC42	P36094	363 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	ECM4	P36156	370 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RGD1	P38339	666 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	MEF2	P39677	819 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	ENT3	P47160	408 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	PEX14	P53112	341 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YGL082W	P53155	381 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	SSL2	Q00578	843 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	TIM50	Q02776	476 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RKM2	Q03942	479 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	PLP1	Q04004	230 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	VTI1	Q04338	217 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YDL121C	Q07541	149 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	NFS1	P25374	497 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	DPB3	P27344	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YKL222C	P35995	705 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	NNK1	P36003	928 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	PIH1	P38768	344 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	AKR1	P39010	764 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YIL092W	P40497	633 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	MDV1	P47025	714 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	IML2	P47031	731 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YNL058C	P53947	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	CIK1	Q01649	594 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	SPO20	Q04359	397 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	HRQ1	Q05549	1077 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	GPR1	Q12361	961 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	PTC5	Q12511	572 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YBT1	P32386	1661 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	LAM4	P38800	1345 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	HIS3	P06633	220 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	APN1	P22936	367 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	PTH2	P34222	208 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	OCT1	P35999	772 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	IRR1	P40541	1150 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	DIP5	P53388	608 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YNL144C	P53907	740 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	INA17	Q02888	182 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	NTE1	Q04958	1679 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	NFU1	P32860	256 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	CCL1	P37366	393 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	APD1	P38281	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YJR054W	P47114	497 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YKU80	Q04437	629 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	ARV1	Q06541	321 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YDL073W	Q07454	984 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RSA1	Q08932	381 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	GNT1	Q12096	491 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	ACF2	Q12168	779 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	MSH5	Q12175	901 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	TAF3	Q12297	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	RSR1	P13856	272 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	HNM1	P19807	563 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	BAS1	P22035	811 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	LYP1	P32487	611 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	MKK2	P32491	506 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	GDA1	P32621	518 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	TOM20	P35180	183 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	MCM7	P38132	845 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DOA4	YDR069C	FZO1	P38297	855 aa		3.34	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms