RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.75■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 TSC1Q92574 1164 aa15.75■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.75■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 CIAO1O76071 339 aa15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 PTGS1P23219 599 aa15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 SCARF1Q14162 830 aa15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 BICD2Q8TD16 824 aa15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 C4AP0C0L4 1744 aa15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 C4BP0C0L5 1744 aa15.74■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 H3BQV1 296 aa15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 IFFO2Q5TF58 517 aa15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 BRINP3Q76B58 766 aa15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC25Q9H1X3 360 aa15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 USP28Q96RU2 1077 aa15.73■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087WWV3 80 aa15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 ATG3Q9NT62 314 aa15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.72■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF75DP51815 510 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 LRMPQ12912 555 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 PI16Q6UXB8 463 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 NKX2-3Q8TAU0 364 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 GUCY1B3Q02153 619 aa15.71■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
C9orf170-201ENST00000623052 FGD1P98174 961 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 IQCB1Q15051 598 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ENGASEQ8NFI3 743 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ITGB4P16144 1822 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 SYNE4Q8N205 404 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 FAM177BA6PVY3 158 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 EVCP57679 992 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TICAM2Q86XR7 235 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 XAGE2Q96GT9 111 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP45Q9UL16 551 aa15.7■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF165P49910 485 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 FBXL16Q8N461 479 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ANTXR2P58335 489 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 HAND2P61296 217 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 NEDD4P46934 1319 aa15.69■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TCIRG1Q13488 830 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 MYH3P11055 1940 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 IL2RBP14784 551 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 FAM89AQ96GI7 184 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 NBPF3Q9H094 633 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ZAP70P43403 619 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.68■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 TPM3P06753 285 aa15.67■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.67■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.67■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 LRP6O75581 1613 aa15.66■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 FGAP02671 866 aa15.66■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 CSF1RP07333 972 aa15.66■□□□□ 0.1
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms