RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615329.4

RPS6KC1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-209ENST00000615329 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 XBP1P17861 261 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 EPS15P42566 896 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CNNM3Q8NE01 707 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 NEK1Q96PY6 1258 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CRB1P82279 1406 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 FLT4P35916 1363 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 RPS6KB1P23443 525 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 MNAT1P51948 309 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ATP2C2O75185 946 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CAPN2P17655 700 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 UBASH3AP57075 661 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 IFNKQ9P0W0 207 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 GSDMDP57764 484 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 APOBRQ0VD83 1088 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 MAP3K5Q99683 1374 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 GOLIM4O00461 696 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 HOXC9P31274 260 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 PGBD1Q96JS3 809 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ST7Q9NRC1 585 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 A0A1B0GVL5 298 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 EVA1CP58658 441 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 BEND3Q5T5X7 828 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 MICU3Q86XE3 530 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 NEMFO60524 1076 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CHGBP05060 677 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 PTPN21Q16825 1174 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ST3GAL1Q11201 340 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 PROSER3Q2NL68 480 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 NECTIN1Q15223 517 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ANKRD7Q92527 254 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 SUCLG2Q96I99 432 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 MYD88Q99836 296 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 POLA2Q14181 598 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 DRC1Q96MC2 740 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 VPS18Q9P253 973 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 CTAGE5O15320 804 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 TXLNAP40222 546 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 DACH1Q9UI36 760 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS6KC1-209ENST00000615329 SBNO1A3KN83 1393 aa14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.1 ms