RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	GNPAT	O15228	680 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	PRDM1	O75626	825 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	ITGA6	P23229	1130 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	MYL10	Q9BUA6	226 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	GREM2	Q9H772	168 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	BRF1	Q92994	677 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1B0GUL7	405 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	AK2	P54819	239 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	ZPR1	O75312	459 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	PDE8A	O60658	829 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	LARGE1	O95461	756 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	CTSW	P56202	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF2C	Q99661	725 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
CTCFL-222	ENST00000609232	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	SPC24	Q8NBT2	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	SGSM2	O43147	1006 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	HIP1	O00291	1037 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP2B2	Q01814	1243 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	DRC7	Q8IY82	874 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	JAK2	O60674	1132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ITGB4	P16144	1822 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232		G3V3G9	751 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	CPLX1	O14810	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	AK7	Q96M32	723 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	COL15A1	P39059	1388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	LRP6	O75581	1613 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP5J	P18859	108 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ZAP70	P43403	619 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	APOBR	Q0VD83	1088 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	SNX21	Q969T3	373 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	RFC4	P35249	363 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	MICU3	Q86XE3	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM37	O94972	964 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	GJB2	P29033	226 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	SCARF1	Q14162	830 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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