RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558139.1

LHX4-202, Transcript of LIM homeobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene LHX4, Length 721 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4-202ENST00000558139 COL6A3P12111 3177 aa23.05■■□□□ 1.28
LHX4-202ENST00000558139 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
LHX4-202ENST00000558139 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
LHX4-202ENST00000558139 MMP14P50281 582 aa23.03■■□□□ 1.28
LHX4-202ENST00000558139 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.03■■□□□ 1.28
LHX4-202ENST00000558139 MAP3K11Q16584 847 aa23.02■■□□□ 1.28
LHX4-202ENST00000558139 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.02■■□□□ 1.28
LHX4-202ENST00000558139 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.01■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 UNCXA6NJT0 531 aa23.01■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 SASH1O94885 1247 aa23■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 CAP1Q01518 475 aa23■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 FZD1Q9UP38 647 aa23■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.99■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 PRO3102Q9H379 93 aa22.99■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 ATP2B4P23634 1241 aa22.98■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 DACT2Q5SW24 774 aa22.98■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.98■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.98■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 XDHP47989 1333 aa22.98■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 FBXW7Q969H0 707 aa22.97■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 PTPN18Q99952 460 aa22.97■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 MXD3Q9BW11 206 aa22.97■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.97■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.97■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 A0A1W2PPC1 479 aa22.96■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.96■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.96■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.96■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.96■■□□□ 1.27
LHX4-202ENST00000558139 NFE2L2Q16236 605 aa22.95■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.95■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.95■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 COL4A1P02462 1669 aa22.94■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.94■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.94■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.93■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.92■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.92■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.92■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 GJA5P36382 358 aa22.91■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.91■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.91■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 PPP2R1AP30153 589 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 KIF22Q14807 665 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 LRCH3Q96II8 777 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
LHX4-202ENST00000558139 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.89■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 SHISA4Q96DD7 197 aa22.89■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 COA1Q9GZY4 146 aa22.89■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 MED23Q9ULK4 1368 aa22.89■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 PSME4Q14997 1843 aa22.88■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 GNRH1P01148 92 aa22.88■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 PRMT2P55345 433 aa22.88■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 DLGAP5Q15398 846 aa22.88■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.88■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.88■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.87■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 OPTNQ96CV9 577 aa22.86■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.86■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 MTFR1Q15390 333 aa22.85■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 MYO1BO43795 1136 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 PDE8AO60658 829 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 GJA8P48165 433 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 GPR153Q6NV75 609 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 ELP3Q9H9T3 547 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.83■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 GTF2A2P52657 109 aa22.83■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 CCL15Q16663 113 aa22.83■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.83■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.83■■□□□ 1.25
LHX4-202ENST00000558139 LAMA3Q16787 3333 aa22.83■■□□□ 1.24
LHX4-202ENST00000558139 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.82■■□□□ 1.24
LHX4-202ENST00000558139 GJB1P08034 283 aa22.82■■□□□ 1.24
LHX4-202ENST00000558139 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms