RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ITFG2Q969R8 447 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 H7C1D1 291 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 CA8P35219 290 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 ATP2B2Q01814 1243 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 MYD88Q99836 296 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 C17orf50Q8WW18 174 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 NIM1KQ8IY84 436 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 MED4Q9NPJ6 270 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 PPFIA3O75145 1194 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 HOXB7P09629 217 aa7.21□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 MTFR1LQ9H019 292 aa7.21□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 CAGE1Q8TC20 777 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 USP33Q8TEY7 942 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 ABCF2Q9UG63 623 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 PNMA2Q9UL42 364 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 GUCY2CP25092 1073 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 LMAN1P49257 510 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC80Q76M96 950 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.2□□□□□ -1.26
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