RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519106.1

CLDN23-201, Transcript of claudin 23, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN23, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23-201ENST00000519106 SRGNP10124 158 aa25.28■■□□□ 1.64
CLDN23-201ENST00000519106 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
CLDN23-201ENST00000519106 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.28■■□□□ 1.64
CLDN23-201ENST00000519106 ZAP70P43403 619 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CLDN23-201ENST00000519106 USP26Q9BXU7 913 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN23-201ENST00000519106 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN23-201ENST00000519106 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.27■■□□□ 1.64
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CLDN23-201ENST00000519106 BBOX1O75936 387 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 FAM227BQ96M60 508 aa25.26■■□□□ 1.63
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CLDN23-201ENST00000519106 SGSM2O43147 1006 aa25.25■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.25■■□□□ 1.63
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CLDN23-201ENST00000519106 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
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CLDN23-201ENST00000519106 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.24■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.24■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.24■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 KLRK1P26718 216 aa25.23■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 RASGRF1Q13972 1273 aa25.22■■□□□ 1.63
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CLDN23-201ENST00000519106 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.22■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 A0A0D9SFI3 127 aa25.22■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 GSE1Q14687 1217 aa25.22■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 VPS37DQ86XT2 251 aa25.22■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.22■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 MASTLQ96GX5 879 aa25.22■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 XDHP47989 1333 aa25.21■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 SPATA5Q8NB90 893 aa25.21■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 GPSM2P81274 684 aa25.21■■□□□ 1.63
CLDN23-201ENST00000519106 ZBTB7AO95365 584 aa25.2■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 ALDH1B1P30837 517 aa25.2■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.2■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 H0YIN7 160 aa25.2■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.19■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.19■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.19■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 CHRNA5P30532 468 aa25.18■■□□□ 1.62
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CLDN23-201ENST00000519106 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.18■■□□□ 1.62
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CLDN23-201ENST00000519106 TMC4Q7Z404 712 aa25.17■■□□□ 1.62
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CLDN23-201ENST00000519106 SP8Q8IXZ3 490 aa25.17■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.17■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 UFL1O94874 794 aa25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 KIF2CQ99661 725 aa25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 GGA1Q9UJY5 639 aa25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 RAD50Q92878 1312 aa25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 OLFM4Q6UX06 510 aa25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 TICAM2Q86XR7 235 aa25.15■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 PTH1RQ03431 593 aa25.14■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.14■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 STYK1Q6J9G0 422 aa25.14■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.14■■□□□ 1.62
CLDN23-201ENST00000519106 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 ATP2B4P23634 1241 aa25.14■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.14■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.14■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.13■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.13■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 POLLQ9UGP5 575 aa25.13■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 MED23Q9ULK4 1368 aa25.13■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 CACNA1SQ13698 1873 aa25.13■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.12■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.12■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 MTFR1LQ9H019 292 aa25.12■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.12■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 C6orf229H3BNL8 230 aa25.11■■□□□ 1.61
CLDN23-201ENST00000519106 MCCP23508 829 aa25.11■■□□□ 1.61
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