RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 BNIP3LO60238 219 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ITGA6P23229 1130 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ZAP70P43403 619 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 IGBP1P78318 339 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 BICDL1Q6ZP65 573 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 TREML1Q86YW5 311 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 RHPN1Q8TCX5 695 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 EDEM1Q92611 657 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 PMEPA1Q969W9 287 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 WWC3Q9ULE0 1092 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1B0GTH6 734 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 FURINP09958 794 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 KRT76Q01546 638 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 TYRO3Q06418 890 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 SERINC3Q13530 473 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 PTPROQ16827 1216 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 IFT43Q96FT9 208 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 CHMP4AQ9BY43 222 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 DYRK1BQ9Y463 629 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 GAS6Q14393 721 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 TAF7LQ5H9L4 462 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 GPR152Q8TDT2 470 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 PPP4R2Q9NY27 417 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 C2CD2LO14523 706 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 F11P03951 625 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 CD33P20138 364 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 RACK1P63244 317 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 BTLAQ7Z6A9 289 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 VWA5B2Q8N398 1253 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 SNX29Q8TEQ0 813 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 SPACA7Q96KW9 195 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 FAM161BQ96MY7 647 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 GGNBP2Q9H3C7 697 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 IDH3AP50213 366 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 NBPF1Q3BBV0 1214 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 KCNMB2Q9Y691 235 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 WDR97A6NE52 1622 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.17□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC30A3Q99726 388 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 CRISPLD1Q9H336 500 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 PIF1Q9H611 641 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 BRD7Q9NPI1 651 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 KCNQ5Q9NR82 932 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 GGT7Q9UJ14 662 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 TRAK1Q9UPV9 953 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 TGFBR3LH3BV60 316 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 MICAL2O94851 1124 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 MAPTP10636 758 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 TARSP26639 723 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 GSTT1P30711 240 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 TNNI2P48788 182 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ARSHQ5FYA8 562 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 SV2AQ7L0J3 742 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa3.16□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 ZFATQ9P243 1243 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.16□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 GALNT12Q8IXK2 581 aa3.16□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 CEP63Q96MT8 703 aa3.16□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 TMEM63CQ9P1W3 806 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 EFSO43281 561 aa3.15□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 SOX9P48436 509 aa3.15□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ANAPC15P60006 121 aa3.15□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ORC1Q13415 861 aa3.15□□□□□ -1.9
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