RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503613.5

FBXO38-206, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 627 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-206	ENST00000503613	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FBXO38-206	ENST00000503613	RUFY3	Q7L099	469 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FBXO38-206	ENST00000503613	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FBXO38-206	ENST00000503613	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FBXO38-206	ENST00000503613	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FBXO38-206	ENST00000503613	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FBXO38-206	ENST00000503613	ADRA2B	P18089	450 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	AK2	P54819	239 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	SCARF1	Q14162	830 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	SETDB2	Q96T68	719 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	COL4A1	P02462	1669 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	MCAM	P43121	646 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ZAP70	P43403	619 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ANKRD1	Q15327	319 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	CCDC102B	Q68D86	513 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	MAST3	O60307	1309 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	APPBP2	Q92624	585 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	CHGB	P05060	677 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	RPS6KB1	P23443	525 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	RFC4	P35249	363 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	PHKA1	P46020	1223 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613		M0R2C6	588 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	CPA1	P15085	419 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ADD2	P35612	726 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	CHRND	Q07001	517 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	GSE1	Q14687	1217 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	UBE3C	Q15386	1083 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	OSBP2	Q969R2	916 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	NLRP3	Q96P20	1036 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	CYP21A2	P08686	494 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	UBE4A	Q14139	1066 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	WASHC4	Q2M389	1173 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	PI16	Q6UXB8	463 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	SMIM5	Q71RC9	77 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	SPATA5	Q8NB90	893 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		12.77	□□□□□ -0.36
FBXO38-206	ENST00000503613	BRD1	O95696	1058 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	TRAK2	O60296	914 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	RASGRF1	Q13972	1273 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	GPAA1	O43292	621 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	PHF14	O94880	888 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	PDE6A	P16499	860 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	MAP3K12	Q12852	859 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	CACNA1S	Q13698	1873 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	PKP1	Q13835	747 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FBXO38-206	ENST00000503613	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37

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