RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 RNF20Q5VTR2 975 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 ESPNB1AK53 854 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 SLC5A1P13866 664 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 EP400Q96L91 3159 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 SSFA2P28290 1259 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSPAN4-212ENST00000494815 PHF14O94880 888 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 SCARF1Q14162 830 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC102BQ68D86 513 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-212ENST00000494815 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 NLRP3Q96P20 1036 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 MCAMP43121 646 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 ZAP70P43403 619 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 TMX3Q96JJ7 454 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 SLC27A2O14975 620 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CHGBP05060 677 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CHRNDQ07001 517 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 TTC14Q96N46 770 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 PHKA1P46020 1223 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 PSMA5P28066 241 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CUL4AQ13619 759 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CASZ1Q86V15 1759 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 NFIXQ14938 502 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 PI16Q6UXB8 463 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 MAST3O60307 1309 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 TXNRD1Q16881 649 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 VPS53Q5VIR6 699 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 KRT32Q14532 448 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 COL4A1P02462 1669 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 RUFY3Q7L099 469 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4-212ENST00000494815 PLSCR1O15162 318 aa22.08■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 APPBP2Q92624 585 aa22.08■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 NPHP1O15259 732 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 RXRBP28702 533 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 UBE4AQ14139 1066 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 GYS1P13807 737 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 AK2P54819 239 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 PROM2Q8N271 834 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 CNBD1Q8NA66 436 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 OSBP2Q969R2 916 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 SPATA5Q8NB90 893 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 MYH7P12883 1935 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 SNAP23O00161 211 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 NUCB2P80303 420 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 WASHC4Q2M389 1173 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 M0R2C6 588 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 RASGRF1Q13972 1273 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 A0A1B0GUL6 1792 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 ADD2P35612 726 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 UBE3CQ15386 1083 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-212ENST00000494815 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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