RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 BIN1O00499 593 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ATP5JP18859 108 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 GSDMDP57764 484 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 CHST3Q7LGC8 479 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 SDF4Q9BRK5 362 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 IFNKQ9P0W0 207 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 GORABQ5T7V8 394 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 DBNDD2Q9BQY9 259 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 KCND1Q9NSA2 647 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.95□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 MYL6BP14649 208 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 NDUFA8P51970 172 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 TNNI3KQ59H18 835 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 EID1Q9Y6B2 187 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 SLIT1O75093 1534 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PDIA6Q15084 440 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 CLCN6P51797 869 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 MYD88Q99836 296 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM51Q9NW97 253 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 NCAPD2Q15021 1401 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 LTN1O94822 1766 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 MRC1P22897 1456 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 GCKRQ14397 625 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 IMPACTQ9P2X3 320 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.93□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC93Q567U6 631 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ISM2Q6H9L7 571 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 CLIC4Q9Y696 253 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 SALL1Q9NSC2 1324 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC66A2RUB6 948 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 NEDD4P46934 1319 aa11.92□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 KCNA6P17658 529 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 SLC39A6Q13433 755 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 HOMER1Q86YM7 354 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 HAUS7Q99871 368 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 TBX22Q9Y458 520 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PTPN21Q16825 1174 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 DNAI1Q9UI46 699 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ABCC6O95255 1503 aa11.91□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 GOLIM4O00461 696 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 STK38Q15208 465 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ATL3Q6DD88 541 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ADALQ6DHV7 355 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 COPS6Q7L5N1 327 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 COPRSQ9NQ92 184 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 E7EWF7 191 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms