RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 LARGE1O95461 756 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CYP21A2P08686 494 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CUL4AQ13619 759 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 PARP10Q53GL7 1025 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CCDC102BQ68D86 513 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CHADLQ6NUI6 762 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CLEC4GQ6UXB4 293 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 NECAB1Q8N987 351 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 BCL2L12Q9HB09 334 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 ZNF652Q9Y2D9 606 aa4.94□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 ZPR1O75312 459 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 BCAMP50895 628 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 NUCB2P80303 420 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CCDC152Q4G0S7 254 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RNF20Q5VTR2 975 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 MCTP1Q6DN14 999 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 GBP4Q96PP9 640 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RPS6KA4O75676 772 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 GABBR2O75899 941 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TRIM37O94972 964 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 ME3Q16798 604 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 LPIN2Q92539 896 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 KCNB2Q92953 911 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 SETDB2Q96T68 719 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 MAST3O60307 1309 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 NWD2Q9ULI1 1742 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 M0R2C6 588 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 NPHP1O15259 732 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RFC4P35249 363 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 HAND2P61296 217 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 STK3Q13188 491 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RASGRF1Q13972 1273 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CHST3Q7LGC8 479 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 FBXO41Q8TF61 875 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 NARFQ9UHQ1 456 aa4.93□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 MROH5Q6ZUA9 1318 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 DDX11L8A8MPP1 907 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 FOXP2O15409 715 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 PPFIA3O75145 1194 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 FGAP02671 866 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 FGFR2P21802 821 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 PSMA5P28066 241 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CHRNDQ07001 517 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 STOX1Q6ZVD7 989 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 AK7Q96M32 723 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 NEK1Q96PY6 1258 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 HELLSQ9NRZ9 838 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RIC1Q4ADV7 1423 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 SYT1P21579 422 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RPS6KB1P23443 525 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 GYG1P46976 350 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 FGD1P98174 961 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TSGA10IPQ3SY00 556 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TPRNQ4KMQ1 711 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TRAPPC3LQ5T215 181 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 SLC51AQ86UW1 340 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 SPATA5Q8NB90 893 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 GDPD2Q9HCC8 539 aa4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 TAF1P21675 1872 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 GPAA1O43292 621 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-208ENST00000478932 BRD1O95696 1058 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms