RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTGIRP43119 386 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRELD1Q96HD1 420 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLRP3Q96P20 1036 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AK5Q9Y6K8 562 aa11.8□□□□□ -0.52
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYOM2P54296 1465 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIP4K2BP78356 416 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POTEGQ6S5H5 508 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.79□□□□□ -0.52
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC16Q8NEE8 873 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA32Q96LK8 384 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.79□□□□□ -0.52
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPN10Q9HC96 672 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPG7Q9UQ90 795 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.78□□□□□ -0.52
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ORC1Q13415 861 aa11.77□□□□□ -0.53
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO41Q8TF61 875 aa11.77□□□□□ -0.53
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIK3R4Q99570 1358 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEN1O00255 615 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CBLBQ13191 982 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NNTQ13423 1086 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.76□□□□□ -0.53
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 HCSTQ9UBK5 93 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIF1AQ16665 826 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTSHP09668 335 aa11.74□□□□□ -0.53
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 C8orf34Q49A92 452 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.74□□□□□ -0.53
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALDH1A1P00352 501 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARMC5Q96C12 935 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TONSLQ96HA7 1378 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP2B1P20020 1258 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GMLQ99445 158 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCS1LQ9Y276 419 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGRB1O14514 1584 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MSH6P52701 1360 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GIPC1O14908 333 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOM1O60784 492 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MICAL2O94851 1124 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TXLNAP40222 546 aa11.71□□□□□ -0.53
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMC1P11047 1609 aa11.71□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTCH1Q13635 1447 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNASQ5JWF2 1037 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITPKCQ96DU7 683 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGBL1Q96MI9 1066 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRAM1Q96QH2 718 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OPLAHO14841 1288 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPC1P35052 558 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC19A1P41440 591 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RELBQ01201 579 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IER5Q5VY09 327 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCC11Q96J66 1382 aa11.68□□□□□ -0.54
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