RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401533.6

GAREM2-201, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GAREM2, Length 4,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-201ENST00000401533 MTMR6Q9Y217 621 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 TNNT1P13805 278 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 LIG1P18858 919 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 ZAP70P43403 619 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 UVSSAQ2YD98 709 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 USP31Q70CQ4 1352 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 ITGA6P23229 1130 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.55■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 ERBB3P21860 1342 aa21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 CNNM3Q8NE01 707 aa21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 MYL10Q9BUA6 226 aa21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 ZBTB43O43298 467 aa21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 TMC6Q7Z403 805 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 ATP5JP18859 108 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 IL25Q9H293 177 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 B4E1Z4 1266 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.53■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 IGKV5-2P06315 115 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 CYP7A1P22680 504 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 STX1AQ16623 288 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 ITSN1Q15811 1721 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 NGLY1Q96IV0 654 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 PTPN14Q15678 1187 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.52■■□□□ 1.04
GAREM2-201ENST00000401533 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 POLA2Q14181 598 aa21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 TTC6Q86TZ1 520 aa21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 PI16Q6UXB8 463 aa21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 CBX1P83916 185 aa21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 TSC1Q92574 1164 aa21.51■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 TMEM94Q12767 1356 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 GPAA1O43292 621 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 CHGBP05060 677 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 A0A087WWV3 80 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 CUL4AQ13619 759 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 MAP7D2Q96T17 732 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 OFD1O75665 1012 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 MAP4K1Q92918 833 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.5■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 CRB1P82279 1406 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 CTAGE5O15320 804 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 CYP27B1O15528 508 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 ZPR1O75312 459 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 ADORA1P30542 326 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 SYKP43405 635 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 USP5P45974 858 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 SLAIN2Q9P270 581 aa21.49■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 SPTLC2O15270 562 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 CYP21A2P08686 494 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 DDB1Q16531 1140 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 IQCA1Q86XH1 822 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 PHKBQ93100 1093 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 MBD4O95243 580 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 WTAPQ15007 396 aa21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 SMTNL1A8MU46 457 aa21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 E7EWF7 191 aa21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 WASF1Q92558 559 aa21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 RGS12O14924 1447 aa21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.47■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 PRDM1O75626 825 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 TXLNAP40222 546 aa21.46■■□□□ 1.03
GAREM2-201ENST00000401533 SPECC1Q5M775 1068 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms