RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC35F4A4IF30 521 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP17L5A8MUK1 530 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 VSIG8P0DPA2 414 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKRD24Q8TF21 1146 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU1-38P-201ENST00000362817 RTL1A6NKG5 1358 aa10.21□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 DISP2A7MBM2 1401 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRC37A3O60309 1634 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL2RAP01589 272 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 AMPHP49418 695 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM50Q86XT4 487 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 NSD2O96028 1365 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 WIPF1O43516 503 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATP9BO43861 1147 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 VEGFBP49765 207 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 CENPCQ03188 943 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 NCOA4Q13772 614 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM182BQ5T319 152 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 HRH3Q9Y5N1 445 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 RGPD2P0DJD1 1756 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 FLT4P35916 1363 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 GDF10P55107 478 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 ETNK1Q9HBU6 452 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 INSRP06213 1382 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 INHAP05111 366 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 ITGA6P23229 1130 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 GNASQ5JWF2 1037 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 UCN2Q96RP3 112 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 NLRP2Q9NX02 1062 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLKQ9UBT6 870 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP17L3A6NCW0 530 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP17L4A6NCW7 530 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATP1A2P50993 1020 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 GTF2IP78347 998 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE3BQ13370 1112 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBPF15Q8N660 670 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 GMCL1Q96IK5 515 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCNN1DP51172 638 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 POU4F2Q12837 409 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 TLR1Q15399 786 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDB1Q16531 1140 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 MORC1Q86VD1 984 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERBB4Q15303 1308 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 BACH1O14867 736 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL2RBP14784 551 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 RHOQP17081 205 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBPF6Q5VWK0 638 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBPF4Q96M43 638 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNS2Q63HR2 1409 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.14□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.13□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 RHBDD1Q8TEB9 315 aa10.13□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa10.13□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 NCAPD2Q15021 1401 aa10.13□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 MEGF6O75095 1541 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 EXOC5O00471 708 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 GMPRP36959 345 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEFB132Q7Z7B7 95 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZMYND15Q9H091 742 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 BCL9O00512 1426 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU1-38P-201ENST00000362817 SHANK3Q9BYB0 1731 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms