RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH1L1O75891 902 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 GIMAP7Q8NHV1 300 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 PLIN2Q99541 437 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 APOBRQ0VD83 1088 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf50Q9HD87 102 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 MCM7P33993 719 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 MICALCLQ6ZW33 695 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 TOM1O60784 492 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 GNAQP50148 359 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K9P80192 1104 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 SP4Q02446 784 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PRG0 241 aa25.45■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.45■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 HSF2BPO75031 334 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 BMP15O95972 392 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 KRT2P35908 639 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 ATP2C2O75185 946 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 CEP112Q8N8E3 955 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 FERP16591 822 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 USP37Q86T82 979 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 KRT24Q2M2I5 525 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 OTUD6BQ8N6M0 293 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 UVSSAQ2YD98 709 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 TNNQ9UQP3 1299 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 FAM13AO94988 1023 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 DACT1Q9NYF0 836 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 RTL1A6NKG5 1358 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 RTL9Q8NET4 1388 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 PSMA7O14818 248 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB9Q96C00 473 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 F13A1P00488 732 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 STX17P56962 302 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 TRAF1Q13077 416 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 GSTA5Q7RTV2 222 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM75PA6NK02 468 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 IMPG2Q9BZV3 1241 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC50Q8IVM0 306 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 TSPYL6Q8N831 410 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 KRT79Q5XKE5 535 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 SKILP12757 684 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PTPRM-201ENST00000332175 SPTLC2O15270 562 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 GNAT2P19087 354 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 DNAI1Q9UI46 699 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 JDP2Q8WYK2 163 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 SELENOOQ9BVL4 669 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 PLVAPQ9BX97 442 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 POLD1P28340 1107 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 WDR70Q9NW82 654 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 AK2P54819 239 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 SYT1P21579 422 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 POLKQ9UBT6 870 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 UBXN1Q04323 297 aa25.36■■□□□ 1.65
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