RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC27A2O14975 620 aa26.24■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.24■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC14Q96N46 770 aa26.24■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHKA1P46020 1223 aa26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFIXQ14938 502 aa26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXNRD1Q16881 649 aa26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DOCK2Q92608 1830 aa26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLSCR1O15162 318 aa26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PROM2Q8N271 834 aa26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMX3Q96JJ7 454 aa26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.22■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RXRBP28702 533 aa26.21■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUL4AQ13619 759 aa26.21■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PI16Q6UXB8 463 aa26.21■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.21■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.21■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAST3O60307 1309 aa26.21■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.21■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GYS1P13807 737 aa26.2■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.2■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMA5P28066 241 aa26.19■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.19■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE4AQ14139 1066 aa26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS53Q5VIR6 699 aa26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APPBP2Q92624 585 aa26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNBD1Q8NA66 436 aa26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.18■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNAP23O00161 211 aa26.17■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TM4SF1P30408 202 aa26.17■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT32Q14532 448 aa26.17■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.17■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RUFY3Q7L099 469 aa26.17■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSBP2Q969R2 916 aa26.17■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA5Q8NB90 893 aa26.16■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.16■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 M0R2C6 588 aa26.15■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AK2P54819 239 aa26.15■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASGRF1Q13972 1273 aa26.15■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADD2P35612 726 aa26.15■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPHP1O15259 732 aa26.14■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE3CQ15386 1083 aa26.14■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.14■■□□□ 1.78
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.13■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa26.13■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APBA3O96018 575 aa26.12■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCAMP50895 628 aa26.12■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WASHC4Q2M389 1173 aa26.12■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.12■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.12■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP21A2P08686 494 aa26.12■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.12■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPA1P15085 419 aa26.11■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUCB2P80303 420 aa26.11■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.11■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKT1S1Q96B36 256 aa26.11■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAMA4Q16363 1823 aa26.11■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.1■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SERPINB2P05120 415 aa26.1■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS6KB1P23443 525 aa26.1■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE6AP16499 860 aa26.09■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRY2Q49AN0 593 aa26.09■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.08■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ST5P78524 1137 aa26.08■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRAPQ13588 217 aa26.08■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF827Q17R98 1081 aa26.08■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXP2O15409 715 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K12Q12852 859 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO41Q8TF61 875 aa26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms