RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 SRGNP10124 158 aa20.18■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.18■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.18■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 FAM227BQ96M60 508 aa20.18■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 MED23Q9ULK4 1368 aa20.17■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 CRY2Q49AN0 593 aa20.17■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 METTL24Q5JXM2 366 aa20.17■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.17■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.17■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 SLX4Q8IY92 1834 aa20.17■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 A0A0D9SFI3 127 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 MASTLQ96GX5 879 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 PIM2Q9P1W9 311 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 ST18O60284 1047 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 NPR1P16066 1061 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 ADORA1P30542 326 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 ATP2B3Q16720 1220 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 STYK1Q6J9G0 422 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 XAGE2Q96GT9 111 aa20.16■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.15■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.15■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 TICAM2Q86XR7 235 aa20.15■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.15■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
FBXO4-201ENST00000281623 DDIT3P35638 169 aa20.14■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 PTH1RQ03431 593 aa20.14■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 NBR1Q14596 966 aa20.14■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.14■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.14■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 PDE8BO95263 885 aa20.13■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.13■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 TTLL6Q8N841 843 aa20.13■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 CNKSR1Q969H4 720 aa20.13■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.13■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 GOLIM4O00461 696 aa20.12■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 IL27Q8NEV9 243 aa20.12■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 KCNB2Q92953 911 aa20.12■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.12■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 COL4A1P02462 1669 aa20.12■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 ALDH1B1P30837 517 aa20.11■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 NEK4P51957 841 aa20.11■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.11■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 GORABQ5T7V8 394 aa20.11■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.11■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 MAP4K1Q92918 833 aa20.1■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 BCS1LQ9Y276 419 aa20.1■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 FGFR2P21802 821 aa20.1■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 NECTIN1Q15223 517 aa20.1■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 NFKBIBQ15653 356 aa20.1■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 RASEFQ8IZ41 740 aa20.1■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.1■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.09■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.09■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 GPR162Q16538 588 aa20.09■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.09■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.09■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 A0A1B0GUL6 1792 aa20.08■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 MCM2P49736 904 aa20.08■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
FBXO4-201ENST00000281623 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 CHGBP05060 677 aa20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 SCARF1Q14162 830 aa20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 SLC51AQ86UW1 340 aa20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 LPIN2Q92539 896 aa20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 CHD4Q14839 1912 aa20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 TAF5LO75529 589 aa20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.06■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 GRAPQ13588 217 aa20.06■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.06■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.06■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 MCAMP43121 646 aa20.05■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.05■□□□□ 0.8
FBXO4-201ENST00000281623 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms