RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 KCNK9Q9NPC2 374 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 MAPKBP1O60336 1514 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 FANCCQ00597 558 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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CTIF-201ENST00000256413 JRKLQ9Y4A0 524 aa18.16■□□□□ 0.5
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CTIF-201ENST00000256413 IQCA1Q86XH1 822 aa18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-201ENST00000256413 EFCAB8A8MWE9 144 aa18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-201ENST00000256413 PEX19P40855 299 aa18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-201ENST00000256413 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.14■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 CATIPQ7Z7H3 387 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 GNGT1P63211 74 aa18.13■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 METTL24Q5JXM2 366 aa18.13■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GVL5 298 aa18.13■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 E7EVH7 732 aa18.13■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 IFT20Q8IY31 132 aa18.13■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 CHMLP26374 656 aa18.13■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 WWC2Q6AWC2 1192 aa18.13■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.13■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 PPFIA4O75335 1185 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 NEDD9Q14511 834 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 LRMPQ12912 555 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 STRN4Q9NRL3 753 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 CIB2O75838 187 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 BRAPQ7Z569 592 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.496e-6■□□□□ 9
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CTIF-201ENST00000256413 FAM184BQ9ULE4 1060 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 MRVI1Q9Y6F6 885 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ACTN2P35609 894 aa18.11■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.11■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.11■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 BRD1O95696 1058 aa18.11■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 PTPDC1A2A3K4 754 aa18.1■□□□□ 0.49
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CTIF-201ENST00000256413 CABP4P57796 275 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 ATP5DP30049 168 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 FERP16591 822 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 MAP3K12Q12852 859 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-201ENST00000256413 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
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