RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 MED23Q9ULK4 1368 aa21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 A0A1B0GVL5 298 aa21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 ZNF75DP51815 510 aa21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 NPHP1O15259 732 aa21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 STX1AQ16623 288 aa21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 RESTQ13127 1097 aa21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 ANO10Q9NW15 660 aa21.55■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 NRDCO43847 1150 aa21.54■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.54■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 ZNF213O14771 459 aa21.54■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 TPM4P67936 248 aa21.54■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.54■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 PFKFB2O60825 505 aa21.54■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 RXRAP19793 462 aa21.54■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.53■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 ZNF609O15014 1411 aa21.53■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.53■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 PRC1O43663 620 aa21.53■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 CTAGE5O15320 804 aa21.52■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.52■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.52■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 ADORA1P30542 326 aa21.52■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 NBPF26B4DH59 902 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 ATP2B1P20020 1258 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 NBPF14Q5TI25 921 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 PI16Q6UXB8 463 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 NBPF15Q8N660 670 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 XAGE2Q96GT9 111 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 MAST3O60307 1309 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 TRIM29Q14134 588 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 OSBP2Q969R2 916 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 SKILP12757 684 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 M0R2C6 588 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 ZAP70P43403 619 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 MICU3Q86XE3 530 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 FOXO4P98177 505 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 NCOA7Q8NI08 942 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 CACNA1FO60840 1977 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 H7C1W4 665 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 ARID5BQ14865 1188 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.48■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 PTPN14Q15678 1187 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 HOMER1Q86YM7 354 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 COL15A1P39059 1388 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 CAVIN2O95810 425 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 FGAP02671 866 aa21.47■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.46■■□□□ 1.03
LRP3-201ENST00000253193 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
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