RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 NACA2Q9H009 215 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 JADE2Q9NQC1 790 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 FAM83GA6ND36 823 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 AFMP43652 599 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 MBIPQ9NS73 344 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 GAS8O95995 478 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 FANCAO15360 1455 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 NCOA1Q15788 1441 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 HAUS7Q99871 368 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 SLC5A4Q9NY91 659 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 GGA1Q9UJY5 639 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 JAG2Q9Y219 1238 aa11.98□□□□□ -0.49
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TRPS1-201ENST00000220888 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 MIGA1Q8NAN2 632 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 DCAF5Q96JK2 942 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 SYKP43405 635 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 GSDMDP57764 484 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGEF6Q15052 776 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 TMC6Q7Z403 805 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 DENND2AQ9ULE3 1009 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 PLCH2O75038 1416 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CBX1P83916 185 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 MAGEB6Q8N7X4 407 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 SPAG1Q07617 926 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC77Q9BR77 488 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 ISM2Q6H9L7 571 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 FNBP1Q96RU3 617 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 FAM169AQ9Y6X4 670 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 ABCC5O15440 1437 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 MCM4P33991 863 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC50Q8IVM0 306 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 TMX1Q9H3N1 280 aa11.97□□□□□ -0.49
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TRPS1-201ENST00000220888 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 PARP10Q53GL7 1025 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 ZBED4O75132 1171 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 BIRC3Q13489 604 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CEP112Q8N8E3 955 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC63Q8NA47 563 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 BCS1LQ9Y276 419 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 ARAP1Q96P48 1450 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM75PA6NK02 468 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 POTEB2H3BUK9 544 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 NEMFO60524 1076 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 SPATA24Q86W54 205 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 AZI2Q9H6S1 392 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PAG1Q9NWQ8 432 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 USP21Q9UK80 565 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 RBM10P98175 930 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 BACH2Q9BYV9 841 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 CSADQ9Y600 493 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 SMTNP53814 917 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 IFT74Q96LB3 600 aa11.95□□□□□ -0.5
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TRPS1-201ENST00000220888 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 WDR44Q5JSH3 913 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 HACE1Q8IYU2 909 aa11.95□□□□□ -0.5
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TRPS1-201ENST00000220888 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 SYNJ1O43426 1573 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 KIF14Q15058 1648 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 STX10O60499 249 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 USP48Q86UV5 1035 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-201ENST00000220888 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
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