RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa26.83■■□□□ 1.89
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbxo33Q8VE08 562 aa26.83■■□□□ 1.89
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa26.83■■□□□ 1.89
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scn11aQ9R053 1765 aa26.83■■□□□ 1.89
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GabrdP22933 449 aa26.82■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gsdma2Q32M21 443 aa26.82■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SkilQ60665 675 aa26.82■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cnot7Q60809 285 aa26.82■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FanclQ9CR14 375 aa26.82■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Neurod6P48986 337 aa26.81■■□□□ 1.88
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm2163Q6PCY5 473 aa26.81■■□□□ 1.88
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Terf1P70371 421 aa26.8■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ascc2Q91WR3 749 aa26.8■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atl3Q91YH5 541 aa26.8■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fzd9Q9R216 592 aa26.8■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 WasP70315 520 aa26.79■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NrapQ80XB4 1728 aa26.79■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Speer4dL7N216 212 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Csrnp1P59054 583 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aldh8a1Q8BH00 487 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam102bQ8BQS4 339 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atg4aQ8C9S8 396 aa26.78■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LifrP42703 1092 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp2b3Q0VF55 1220 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa26.77■■□□□ 1.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kifc2O08672 792 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf692Q3U381 531 aa26.76■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nphp3Q7TNH6 1325 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 D1Pas1P16381 660 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Casp1P29452 402 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Timm10P62073 90 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mctp2Q5RJH2 878 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cgnl1Q6AW69 1298 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Shtn1Q8K2Q9 631 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Osbpl5Q9ER64 874 aa26.75■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gcc1Q9D4H2 778 aa26.74■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4340L7N2C4 268 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kiaa0753Q6A000 959 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ParvgQ9ERD8 331 aa26.73■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp17lbE9Q9U0 468 aa26.72■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LeprP48356 1162 aa26.72■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc51Q3URS9 406 aa26.72■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc27Q3V036 639 aa26.72■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Large2Q5XPT3 690 aa26.72■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 WdpcpQ8C456 722 aa26.72■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hoxa7P02830 229 aa26.71■■□□□ 1.87
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf18Q810A1 556 aa26.71■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc26a8Q8R0C3 999 aa26.71■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa26.71■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppil2Q9D787 521 aa26.71■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Peak1Q69Z38 1735 aa26.7■■□□□ 1.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cxcl9P18340 126 aa26.7■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Agtpbp1Q641K1 1218 aa26.7■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem130Q6NXM3 419 aa26.7■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ift57Q8BXG3 429 aa26.7■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cetn4Q8K4K1 168 aa26.7■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myh15E9Q264 1925 aa26.7■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GabreA2AMW3 916 aa26.69■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TsksO54887 585 aa26.69■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cap1P40124 474 aa26.69■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q3UJP5 209 aa26.69■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fchsd1Q6PFY1 688 aa26.69■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asap2Q7SIG6 958 aa26.69■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SisF8VQM5 1818 aa26.69■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem266Q8BZB3 538 aa26.68■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa26.68■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mcm2P97310 904 aa26.67■■□□□ 1.86
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc146E9Q9F7 977 aa26.66■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd13cQ3UX43 541 aa26.66■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RubcnQ80U62 956 aa26.66■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Glrx3Q9CQM9 337 aa26.66■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa26.65■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sptlc3Q8BG54 563 aa26.65■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccne2Q9Z238 404 aa26.65■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tm4sf4Q91XD3 202 aa26.64■■□□□ 1.86
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