RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623935.1

SOX9-AS1-217, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 1,563 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-217ENST00000623935 INSL4Q14641 139 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SLC22A25Q6T423 547 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TPRA1Q86W33 373 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PP6455Q8WZ26 134 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SPSB4Q96A44 273 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FGGYQ96C11 551 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DACH2Q96NX9 599 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DERL3Q96Q80 235 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NOX4Q9NPH5 578 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 STARD10Q9Y365 291 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NBASA2RRP1 2371 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A0A1B0GTI1 187 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MEGF11A6BM72 1044 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CDRT1O95170 752 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IL1AP01583 271 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IGLV3-1P01715 115 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 THBDP07204 575 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RANBP1P43487 201 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KIR2DL3P43628 341 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MTNR1BP49286 362 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GSK3AP49840 483 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM3AP98173 230 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DGUOKQ16854 277 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LINC01560Q8TB33 94 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NDNFQ8TB73 568 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RHOVQ96L33 236 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TPK1Q9H3S4 243 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 V9GYS6 101 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ABCD4O14678 606 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MAS1P04201 325 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CD3EP07766 207 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RAC2P15153 192 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RAB3AP20336 220 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RAB3BP20337 219 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SDC2P34741 201 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 THBS4P35443 961 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RORCP51449 518 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MXD1Q05195 221 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BSPH1Q075Z2 132 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TFF3Q07654 80 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CDSNQ15517 529 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BEX5Q5H9J7 111 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LYZL4Q96KX0 146 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TECTBQ96PL2 329 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A0A1W2PPW3 197 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C5orf63A6NC05 138 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A6NIN4 97 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CD300LBA8K4G0 201 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SULT1B1O43704 296 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms