RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	EREG	O14944	169 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SURF4	O15260	269 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF16	O43320	207 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-9	P01782	118 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CD3G	P09693	182 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	NPS	P0C0P6	89 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF7	P21781	194 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	GAL	P22466	123 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CPT2	P23786	658 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPN6	P29350	595 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINF1	P36955	418 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CAV3	P56539	151 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SIRPA	P78324	504 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ACSM1	Q08AH1	577 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SCARB2	Q14108	478 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF345	Q14585	488 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CLINT1	Q14677	625 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	HMGN3	Q15651	99 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FHL5	Q5TD97	284 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5T1	Q8NG75	326 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	UBQLN3	Q9H347	655 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MMP26	Q9NRE1	261 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		6.43	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM30	A4D0T7	59 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495		F5H5P2	479 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFRSF11B	O00300	401 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL21	O00585	134 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OPN1MW	P04001	364 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	IL11	P20809	199 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	DRD5	P21918	477 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	BMP5	P22003	454 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MAS1L	P35410	378 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	THBS2	P35442	1172 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	WNT4	P56705	351 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	AP3S2	P59780	193 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINA11	Q86U17	422 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	KDM8	Q8N371	416 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4K15	Q8NH41	348 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR119	Q8TDV5	335 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM203	Q969S6	136 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ATG101	Q9BSB4	218 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FUZ	Q9BT04	418 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM2	Q9C040	744 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FKRP	Q9H9S5	495 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	IRGM	A1A4Y4	181 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SUV39H1	O43463	412 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	NXPH2	O95156	264 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	UBL3	O95164	117 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB36	O95755	333 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	BPNT1	O95861	308 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-DPB1	P04440	258 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	ACKR3	P25106	362 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SHC1	P29353	583 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MTNR1B	P49286	362 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	TDGF1P3	P51864	188 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SORD	Q00796	357 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	FABP5	Q01469	135 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	PLA2G7	Q13093	441 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	MELK	Q14680	651 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	IDNK	Q5T6J7	187 aa		6.42	□□□□□ -1.38
LETMD1-238	ENST00000623495	HBM	Q6B0K9	141 aa		6.42	□□□□□ -1.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms