RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 TTC9Q92623 222 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CTSFQ9UBX1 484 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PISDQ9UG56 409 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ABCA1O95477 2261 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SERINC4A6NH21 518 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SYNGR2O43760 224 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN13O95857 204 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 EDN1P05305 212 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SP1P08047 785 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CTBSQ01459 385 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PMS2P11Q13670 270 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LHX4Q969G2 390 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 VDAC3Q9Y277 283 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PARP14Q460N5 1801 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RAB27BO00194 218 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 EPHA2P29317 976 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RAG2P55895 527 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CARD18P57730 90 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF480Q8WV37 535 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DOCK7Q96N67 2140 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ARID2Q68CP9 1835 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NRASP01111 189 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CD37P11049 281 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR10J1P30954 320 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 BAP18Q8IXM2 172 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TMED6Q8WW62 240 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 USP3Q9Y6I4 520 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SLURP2P0DP57 97 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CD70P32970 193 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR1C1Q15619 314 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LIPHQ8WWY8 451 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 HSD17B6O14756 317 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RAB38P57729 211 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF738Q8NE65 137 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 HGDQ93099 445 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf50Q96LR7 162 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 IGSF23A1L1A6 192 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 A6NL46 340 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NUDT3O95989 172 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 FZD2Q14332 565 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SEMA4FO95754 770 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CA3P07451 260 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SYT9Q86SS6 491 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF320A2RRD8 509 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NID1P14543 1247 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TNFRSF1AP19438 455 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TEAD1P28347 426 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 HOXC5Q00444 222 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MS4A10Q96PG2 267 aa6.35□□□□□ -1.39
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