RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 H3BSA7 217 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 NGFP01138 241 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 IGHG1P01857 330 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 HLA-HP01893 362 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 LCKP06239 509 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 PGA4P0DJD7 388 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 PGA3P0DJD8 388 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 CLUP10909 449 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 HLA-DOBP13765 273 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 PSMB9P28065 219 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ATP6V1E1P36543 226 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 TGFBR2P37173 567 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ETV1P50549 477 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ACTA2P62736 377 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ACTG2P63267 376 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 GLO1Q04760 184 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF154Q13106 437 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 TPBGQ13641 420 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 FAM189A2Q15884 450 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 MOGQ16653 247 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 PCK2Q16822 640 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 TEX30Q5JUR7 227 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 THEM4Q5T1C6 240 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZPA2 131 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 TIGD4Q8IY51 512 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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SMAD3-215ENST00000560424 OR51G2Q8NGK0 314 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 CCL17Q92583 94 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 OR5M11Q96RB7 305 aa7.85□□□□□ -1.15
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SMAD3-215ENST00000560424 SYT4Q9H2B2 425 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 GPR35Q9HC97 309 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 B9D1Q9UPM9 204 aa7.85□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 RNF114Q9Y508 228 aa7.85□□□□□ -1.15
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SMAD3-215ENST00000560424 RYR3Q15413 4870 aa7.84□□□□□ -1.15
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SMAD3-215ENST00000560424 CCRL2O00421 344 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 PHYHO14832 338 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 TSPAN15O95858 294 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 CD1AP06126 327 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 VSIG8P0DPA2 414 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF35P13682 527 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 CTLA4P16410 223 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 CPEP16870 476 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 GALP22466 123 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 LIPAP38571 399 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 RGS6P49758 472 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R43P59537 309 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 CAMK2DQ13557 499 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 MED22Q15528 200 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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SMAD3-215ENST00000560424 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
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SMAD3-215ENST00000560424 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 KDM8Q8N371 416 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 OTULINQ96BN8 352 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ISOC1Q96CN7 298 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 OPALINQ96PE5 141 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 RBP7Q96R05 134 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 DIRC2Q96SL1 478 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 COQ7Q99807 217 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.84□□□□□ -1.15
SMAD3-215ENST00000560424 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.83□□□□□ -1.16
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
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