RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXA6P31267 233 aa13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDNFQ49AH0 187 aa13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPICQ8N5J4 248 aa13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR1J2Q8NGS2 313 aa13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C15orf40Q8WUR7 153 aa13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDHAF3Q9NRP4 125 aa13.74□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCSK5Q92824 1860 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2M5A3KFT3 312 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGF2P01344 180 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFPL3SP0C7P2 107 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPN1P15169 458 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL11RAQ14626 422 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKIRIN2Q53H80 203 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMUB2Q71RG4 321 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC1AQ8NC01 280 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR1M1Q8NGA1 313 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf40Q8WZ69 217 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MNTQ99583 582 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS2R8Q9NYW2 309 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM82A0PJX8 343 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DISC1C4P0D8 188 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SULT2B1O00204 365 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNAB3O43448 404 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRABP1P29762 137 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 S100A11P31949 105 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOLR3P41439 243 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PMPCAQ10713 525 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX30Q5JUR7 227 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BPIFB2Q8N4F0 458 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR6N1Q8NGY5 312 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST8SIA1Q92185 356 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDCD10Q9BUL8 212 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HES7Q9BYE0 225 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASH2LQ9UBL3 628 aa13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GV90 55 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRPGP15A8MWD9 76 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RP2O75695 350 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNAPINO95295 136 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL5P05113 134 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRYBA1P05813 215 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTGFRP43088 359 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC18Q8N456 261 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR52N4Q8NGI2 321 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IMMP1LQ96LU5 166 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PROK2Q9HC23 129 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RER1O15258 196 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4E1P0C645 316 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JMJD7P0C870 316 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAA40Q86UY6 237 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2Y1Q8NGV0 311 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A28Q96A46 364 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNTD2Q9H8S5 307 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 R4GMQ9 66 aa13.72□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNFSF11O14788 317 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAPPC6AO75865 159 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN17P56750 224 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLRN1P58418 232 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHAF1BQ13112 559 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPX8Q8TED1 209 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CT55Q8WUE5 264 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNK17Q96T54 332 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFFQ9GZY8 342 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLK13Q9UKR3 277 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP3CBP16298 524 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAF13Q15543 124 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GUCA2BQ16661 112 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPINK14Q6IE38 97 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C3orf33Q6P1S2 294 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHOUQ7L0Q8 258 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STEAP2Q8NFT2 490 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFSD8Q8NHS3 518 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC6A7Q99884 636 aa13.71□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2A4O95047 310 aa13.71□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGHV3-9P01782 118 aa13.71□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNB3P16520 340 aa13.71□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACHEP22303 614 aa13.71□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VAMP1P23763 118 aa13.71□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS2R19P59542 299 aa13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms