RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR11L1Q8NGX0 322 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR51F2Q8NH61 342 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 Q96MT0 163 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SIGLEC11Q96RL6 698 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 GAL3ST1Q99999 423 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 FN3KRPQ9HA64 309 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 BRD7Q9NPI1 651 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 FAM206AQ9NX38 181 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 IKZF2Q9UKS7 526 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 DYSFO75923 2080 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SONP18583 2426 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 C5orf63A6NC05 138 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SLC16A6O15403 523 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SULT1C4O75897 302 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 HLA-DPB1P04440 258 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 HNF1AP20823 631 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ANOS1P23352 680 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MDH2P40926 338 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MTNR1AP48039 350 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ACTC1P68032 377 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ACTA1P68133 377 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 CHRFAM7AQ494W8 412 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 AVPI1Q5T686 147 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 GLCCI1Q86VQ1 547 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR8B12Q8NGG6 310 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MBOAT4Q96T53 435 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SLC29A1Q99808 456 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SOX7Q9BT81 388 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 TREM2Q9NZC2 230 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ZNF319Q9P2F9 582 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 ISPDA4D126 451 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 WNT9BO14905 357 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 CST4P01036 141 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 KRT8P05787 483 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 MSMBP08118 114 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 GNALP38405 381 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 IL5RAQ01344 420 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 MOGAT3Q86VF5 341 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 TEX29Q8N6K0 151 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PBOV1Q9GZY1 135 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 SHARPINQ9H0F6 387 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 NARFLQ9H6Q4 476 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 TRIM36Q9NQ86 728 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 R4GMQ9 66 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 IGLV3-1P01715 115 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 GATA3P23771 443 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 MAP2K3P46734 347 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PRSS12P56730 875 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 OR8S1Q8NH09 359 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 TMEM186Q96B77 213 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PCDHB10Q9UN67 800 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PPIAL4EA0A075B759 164 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 DHRS7CA6NNS2 312 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PPIAL4DF5H284 164 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 ENTPD6O75354 484 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PPIAL4FP0DN26 164 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 GABRB1P18505 474 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 KCNJ8Q15842 424 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 GFOD2Q3B7J2 385 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 GALNT4Q8N4A0 578 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 CCDC54Q8NEL0 328 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 OR10H4Q8NGA5 316 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 APOL4Q9BPW4 351 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 MICU1Q9BPX6 476 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 BEX2Q9BXY8 128 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 RNF7Q9UBF6 113 aa15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 ABCA2Q9BZC7 2435 aa15.92■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 METTL15A6NJ78 407 aa15.92■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 TMEM210A6NLX4 147 aa15.92■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PRR32B1ATL7 298 aa15.92■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 FAM157AC9JC47 383 aa15.92■□□□□ 0.14
SYF2-203ENST00000474160 PSMD9O00233 223 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms