RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	NOX3	Q9HBY0	568 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ABCB9	Q9NP78	766 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	SPATA2	Q9UM82	520 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	APOA1	P02647	267 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	PRF1	P14222	555 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	SELE	P16581	610 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ADRA2C	P18825	462 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ATF1	P18846	271 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	PRKACB	P22694	351 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	RAD52	P43351	418 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	GSK3A	P49840	483 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	IDNK	Q5T6J7	187 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	FAM166A	Q6J272	317 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	LYPD6	Q86Y78	171 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	BORCS5	Q969J3	196 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	PTX4	Q96A99	478 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	GHRL	Q9UBU3	117 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	KALRN	O60229	2985 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	CTDSP2	O14595	271 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	RGS5	O15539	181 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	CST4	P01036	141 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	MAS1	P04201	325 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	UBB	P0CG47	229 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF35	P13682	527 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	RAC2	P15153	192 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	AGA	P20933	346 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	TNFSF8	P32971	234 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	TALDO1	P37837	337 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	MAGEB1	P43366	347 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ASCL1	P50553	236 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	PPP5C	P53041	499 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	OR10A3	P58181	314 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	FAM3A	P98173	230 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF92	Q03936	586 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	PPA1	Q15181	289 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	RAB11B	Q15907	218 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	MFSD4A	Q8N468	514 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	GFI1	Q99684	422 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPS18-231	ENST00000472218	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218		A0A0A6YYH2	397 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218		A6NJ64	397 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	CCL21	O00585	134 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	SMPD2	O60906	423 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	NCR1	O76036	304 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	CECR9	P0C854	216 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	BMP4	P12644	408 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	CCNO	P22674	350 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	HTR2C	P28335	458 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	WNT5A	P41221	380 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	ALDH3B1	P43353	468 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	NR4A2	P43354	598 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	EVX1	P49640	407 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	UCP2	P55851	309 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	CAV3	P56539	151 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	SORD	Q00796	357 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPS18-231	ENST00000472218	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms