RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIN1P1O15428 100 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRMP19623 302 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCH1P30793 250 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTNR1BP49286 362 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP3R1P63098 170 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPOCK1Q08629 439 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPCS2Q15005 226 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8B8Q15620 311 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF718Q3SXZ3 478 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCMAPQ5T1S8 102 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXW12Q6X9E4 464 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARP16Q8N5Y8 322 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CMBLQ96DG6 245 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNTG1Q9NSN8 517 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 POU2F3Q9UKI9 436 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHD6Q8TD26 2715 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 WIPF3A6NGB9 483 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDRT1O95170 752 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD3EP07766 207 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAC2P15153 192 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 SELEP16581 610 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAHP16930 419 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDC2P34741 201 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 THBS4P35443 961 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDOSTP39656 456 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS12P56730 875 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVS71-1P61550 626 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 FTMTQ8N4E7 242 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ORAI1Q96D31 301 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 J3QKU1 62 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G2AP14555 144 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLRXP35754 106 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 MXD1Q05195 221 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR56B2PQ8NGI1 322 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSC4DQ8WTU2 575 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PP6455Q8WZ26 134 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R4Q9NYW5 299 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXJ3Q9UPW0 622 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP23Q9Y6H3 246 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD61A6NGH8 418 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDCD5O14737 125 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACKR3P25106 362 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB37Q5TC79 503 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 VHLLQ6RSH7 139 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPRA1Q86W33 373 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRIM1Q9NZV1 1036 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR14LQ5THK1 2151 aa23.58■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD300LBA8K4G0 201 aa23.58■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL1AP01583 271 aa23.58■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSTP19883 344 aa23.58■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP37Q8NFH4 326 aa23.58■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa23.58■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PPW3 197 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSTM5A8MXK1 200 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 FABP6P51161 128 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T2Q6IF00 324 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM5Q6NVV9 412 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM222BQ8WU58 562 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 HAVCR1Q96D42 359 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPK1Q9H3S4 243 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNN3Q9UGI6 736 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCFC1P51610 2035 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAS1P04201 325 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB3AP20336 220 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SELENOVP59797 346 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLVS2Q5SYC1 327 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 C19orf84I3L1E1 186 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB3BP20337 219 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS19P39019 145 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNK1Q13470 666 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNPY1Q3B7I2 92 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 BHLHE23Q8NDY6 225 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1M1Q8NGA1 313 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR13C9Q8NGT0 318 aa23.55■■□□□ 1.36
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PIK3IP1Q96FE7 263 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST5Q9GZS9 411 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEK6Q9HC98 313 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 FZR1Q9UM11 496 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CMAHPQ9Y471 501 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF115Q9Y4L5 304 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEGF11A6BM72 1044 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANXA2P2A6NMY6 339 aa23.54■■□□□ 1.36
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