RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637050.1

CLN3-254, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,684 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-254ENST00000637050 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.97■□□□□ 0.15
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CLN3-254ENST00000637050 PAHP00439 452 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-254ENST00000637050 FAHP16930 419 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-254ENST00000637050 BDKRB2P30411 391 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-254ENST00000637050 GSK3AP49840 483 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-254ENST00000637050 FAM27E3Q08E93 113 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-254ENST00000637050 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-254ENST00000637050 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-254ENST00000637050 UTS2BQ765I0 119 aa15.92■□□□□ 0.14
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CLN3-254ENST00000637050 OR5AS1Q8N127 324 aa15.92■□□□□ 0.14
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