RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TGM7Q96PF1 710 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 IGF2RP11717 2491 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8U8P0C7N1 319 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UBBP0CG47 229 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SPP1P10451 314 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYGSP22914 178 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB11BQ15907 218 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HYAL4Q2M3T9 481 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NAA40Q86UY6 237 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB10Q8WXI3 467 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GNRHR2Q96P88 292 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS7CA6NNS2 312 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 BCKDHBP21953 392 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 THRSPQ92748 146 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MVB12AQ96EY5 273 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MED29Q9NX70 200 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA1BQ00975 2339 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 URADA6NGE7 173 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 AMY2AP04746 511 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TACSTD2P09758 323 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEA2Q15560 299 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SGCAQ16586 387 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZS52 159 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM8Q8N371 416 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5B2Q96R09 309 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC11CQ9BY50 192 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NMES1Q9C002 83 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBA4BQ9H853 241 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MMACHCQ9Y4U1 282 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SOCS1O15524 211 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF208O43345 1280 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 STK17BO94768 372 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF2F2P13984 249 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ACKR3P25106 362 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HRH1P35367 487 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SGCGQ13326 291 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7A5Q15622 319 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CDNFQ49AH0 187 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF542PQ5EBM4 170 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB12Q6IQ22 244 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GRINAQ7Z429 371 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1L3Q8NH93 324 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SHDQ96IW2 340 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 IP6K3Q96PC2 410 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TM2D1Q9BX74 207 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 DCDC2BA2VCK2 349 aa3.18□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN4O14817 238 aa3.18□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 NFYBP25208 207 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 STARD6P59095 220 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SPOCK1Q08629 439 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXF1Q12946 379 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 DTWD2Q8NBA8 298 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBD1Q9UJT1 453 aa3.18□□□□□ -1.9
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