RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ORAI1Q96D31 301 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2G1P62253 170 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LAMP3Q9UQV4 416 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R45P59539 299 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 FOXF1Q12946 379 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB37Q5TC79 503 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ST3GAL6Q9Y274 331 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB4P16144 1822 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SIRPB1O00241 398 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1DO15297 605 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CBR3O75828 277 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 THBS4P35443 961 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf107Q6ZR85 190 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 FAM58AQ8N1B3 248 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 WDR34Q96EX3 536 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TECTBQ96PL2 329 aa19.08■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SPNP16150 400 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2G2P60604 165 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TLE1Q04724 770 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A26Q70HW3 274 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR8U1Q8NH10 309 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SARAFQ96BY9 339 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 LURAP1Q96LR2 239 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 UFSP2Q9NUQ7 469 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ARPC3O15145 178 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 GPR3P46089 330 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ARL16Q0P5N6 197 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 BAMBIQ13145 260 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 LHX8Q68G74 356 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM123Q8N131 208 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OSR2Q8N2R0 312 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 NEURL2Q9BR09 285 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 FAM221AA4D161 298 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 LMO7DNF2Z398 122 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 RAB27BO00194 218 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PLPP2O43688 288 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 RAG2P55895 527 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TEX261Q6UWH6 196 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 FN3KRPQ9HA64 309 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 U3KQ87 197 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SSC5DA1L4H1 1573 aa19.07■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CD300LDQ6UXZ3 194 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM231Q9H6L2 316 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PLAC1Q9HBJ0 212 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 MMP25Q9NPA2 562 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CNIH1O95406 144 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 GLRA1P23415 457 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN15P56746 228 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 BTNL8Q6UX41 500 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 BHLHA9Q7RTU4 235 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 NOXO1Q8NFA2 376 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AP2Q8NGF4 316 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 COX5AP20674 150 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 HES1Q14469 280 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1958Q8N8K9 716 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 DOK1Q99704 481 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TAF1P21675 1872 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 RFPL4AA6NLU0 287 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CRYBB2P43320 205 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 FUT6P51993 359 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 S1PR3Q99500 378 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TPPP3Q9BW30 176 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR1N1Q8NGS0 311 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PLSCR3Q9NRY6 295 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 MTCH1Q9NZJ7 389 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CRYAAP02489 173 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ATF1P18846 271 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 MAMSTRQ6ZN01 415 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFCQ8NFQ6 507 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 LRP12Q9Y561 859 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1CQ13936 2221 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB6O95139 128 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 S100A8P05109 93 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 AANATQ16613 207 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TIGITQ495A1 244 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF787Q6DD87 383 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR52B4Q8NGK2 314 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR4F5Q8NH21 305 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR4F4Q96R69 305 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB127Q9H1M4 99 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OPA3Q9H6K4 179 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TERTO14746 1132 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 HAAOP46952 286 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF793Q6ZN11 406 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 DBX2Q6ZNG2 339 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 GPR32P1Q8NGA4 272 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 A0A096LPE4 126 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPZ6 126 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CLLU1Q5K131 121 aa19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms