RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569899.5

GDE1-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDE1, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-205ENST00000569899 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ABHD4Q8TB40 342 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 NIPAL2Q9H841 368 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 RNF121Q9H920 327 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 GALNT8Q9NY28 637 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 A0A1W2PPK0 400 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 A0A1W2PR80 420 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 CIB4A0PJX0 185 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 M0R135 149 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 TTRP02766 147 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 BMP5P22003 454 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 SLC6A9P48067 706 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 SOX2P48431 317 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 MXD1Q05195 221 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 GABRA6Q16445 453 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ZNF544Q6NX49 715 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 FAM57BQ71RH2 274 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 LUZP2Q86TE4 346 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 NAA40Q86UY6 237 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ORAI1Q96D31 301 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ZNF799Q96GE5 643 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 KCTD7Q96MP8 289 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 COQ7Q99807 217 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 PRR13Q9NZ81 148 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ZNF879B4DU55 563 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 E9PLN8 166 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 P2RY10O00398 339 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 UBL3O95164 117 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 CDRT1O95170 752 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 SERPINA3P01011 423 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ACSM4P0C7M7 580 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 GALP22466 123 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 UGT2B10P36537 528 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 CA7P43166 264 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 TGFBR3Q03167 851 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 MDP1Q86V88 176 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 SPTSSAQ969W0 71 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 WBP1Q96G27 269 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 DERL3Q96Q80 235 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 WACQ9BTA9 647 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 DUSP13Q9UII6 198 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 POLEQ07864 2286 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 CACNA1BQ00975 2339 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 PIN1P1O15428 100 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 LMX1BO60663 402 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 UCHL1P09936 223 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 OCM2P0CE71 109 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ACHEP22303 614 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 SDC2P34741 201 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 OPRM1P35372 400 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ARR3P36575 388 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 RAB1AP62820 205 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 ECH1Q13011 328 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 GSG1Q2KHT4 349 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-205ENST00000569899 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms