RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF878C9JN71 531 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 H3BML4 177 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TSPAN9O75954 239 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CHRM2P08172 466 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 FOSL2P15408 326 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 AKR1C4P17516 323 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 AVPR2P30518 371 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 EMP2P54851 167 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 UQCC3Q6UW78 93 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 RHOUQ7L0Q8 258 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 HOGA1Q86XE5 327 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ANGPTL5Q86XS5 388 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ELP5Q8TE02 316 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 B3GAT1Q9P2W7 334 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 DBX1A6NMT0 343 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 F5H0A9 414 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MC2RQ01718 297 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ATRAIDQ6UW56 229 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 KCTD9Q7L273 389 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 OR4K15Q8NH41 348 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 FBXW5Q969U6 566 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC46Q96FV0 321 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MRGPRX4Q96LA9 322 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 FN3KRPQ9HA64 309 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ANAPC10Q9UM13 185 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.19■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CRHP06850 196 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ACTBL2Q562R1 376 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NOXO1Q8NFA2 376 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 BPIFCQ8NFQ6 507 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 RNF138Q8WVD3 245 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 LHFPL6Q9Y693 200 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MPTX1A8MV57 137 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PMP2P02689 132 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 GIMD1P0DJR0 217 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 GLB1P16278 677 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PSMB6P28072 239 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CX3CR1P49238 355 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CLRN1P58418 232 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MYBPHQ13203 477 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 UEVLDQ8IX04 471 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM185AQ8NFB2 350 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 OR4K17Q8NGC6 315 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 STOML3Q8TAV4 291 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NICN1Q9BSH3 213 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NMES1Q9C002 83 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 HRH3Q9Y5N1 445 aa16.18■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CEP290O15078 2479 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 C5orf51A6NDU8 294 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 IGHG1P01857 330 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MSX1P28360 303 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 FOXL2P58012 376 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 FOXK1P85037 733 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CYCSP99999 105 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 DEFA5Q01523 94 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A53Q5H9E4 307 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 VAX1Q5SQQ9 334 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 RHBDD2Q6NTF9 364 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PGAP1Q75T13 922 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ARRDC1Q8N5I2 433 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CDC6Q99741 560 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 FAM117AQ9C073 453 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 RAB19A4D1S5 217 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PGA4P0DJD7 388 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PGA3P0DJD8 388 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NAT1P18440 290 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms