RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 RBP7Q96R05 134 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 LY6HO94772 140 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 HSMCR30P0CW71 290 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTA2P62736 377 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTG2P63267 376 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB35Q15286 201 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB5R2Q6BCY4 276 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A25Q6T423 547 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35F2Q8IXU6 374 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR31Q8NA23 367 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10H4Q8NGA5 316 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM168AQ92567 244 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG8Q9BVK2 526 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 LPAR3Q9UBY5 353 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35F4A4IF30 521 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 VWC2LB2RUY7 222 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 DCTN6O00399 190 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINI2O75830 405 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TFP02787 698 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 MT-ND5P03915 603 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA5P08648 1049 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R43P59537 309 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF85Q03923 595 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC17A1Q14916 467 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRA6Q16445 453 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2G6Q5TZ20 316 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL14Q8N1E6 418 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNDC15Q96J42 360 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TSSK2Q96PF2 358 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 MALT1Q9UDY8 824 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 PHYHO14832 338 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A7O60669 478 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHG1P01857 330 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PYCR1P32322 319 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 FABP6P51161 128 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GLO1Q04760 184 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 RUNX1T1Q06455 604 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SSX1Q16384 188 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST3H3Q16695 136 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TSTQ16762 297 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CDONQ4KMG0 1287 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX30Q5JUR7 227 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF544Q6NX49 715 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51L1Q8NGJ5 315 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6K6Q8NGW6 343 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GATAD2BQ8WXI9 593 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 COQ7Q99807 217 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 AIREO43918 545 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 LMX1BO60663 402 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 USF1P22415 310 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GALP22466 123 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 EFNA4P52798 201 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 BIDP55957 195 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MELKQ14680 651 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MST1LQ2TV78 715 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SHARPINQ9H0F6 387 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SIAEQ9HAT2 523 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MED29Q9NX70 200 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 POU2F3Q9UKI9 436 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF726A6NNF4 738 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CD1AP06126 327 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 DOC2BQ14184 412 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF684Q5T5D7 378 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 IL17RELQ6ZVW7 336 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF511Q8NB15 262 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 UFD1Q92890 307 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 APH1AQ96BI3 265 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS14Q96SY0 518 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR76Q9H967 626 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CIB4A0PJX0 185 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 H7C1C5 153 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 M0R1B8 84 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PGA4P0DJD7 388 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PGA3P0DJD8 388 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GAAP10253 952 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CTLA4P16410 223 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 LCN6P62502 163 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBA1BP68363 451 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PCK2Q16822 640 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBA1AQ71U36 451 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GPAT4Q86UL3 456 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-216ENST00000628306 OR9K2Q8NGE7 335 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms