RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 HSF2Q03933 536 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 FNDC8Q8TC99 324 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB10Q8WXI3 467 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 MUCL1Q96DR8 90 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R16Q9NYV7 291 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A23A1A5C7 686 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf71A8MTZ7 269 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 CD36P16671 472 aa20.96■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A1P53985 500 aa20.96■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 CD40P25942 277 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.95■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A9Q7RTY1 509 aa20.94■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR52N5Q8NH56 324 aa20.94■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 CPEP16870 476 aa20.93■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 SYS1Q8N2H4 156 aa20.93■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf24Q9BVV8 132 aa20.93■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 SYT4Q9H2B2 425 aa20.93■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 PTAFRP25105 342 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 THEM4Q5T1C6 240 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SHFQ7M4L6 423 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TIGD4Q8IY51 512 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF100Q8IYN0 542 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
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