RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 IL18BPO95998 194 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 CRHP06850 196 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 SFTPCP11686 197 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMP3P35625 211 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS19P39019 145 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 LSAMPQ13449 338 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB35Q15286 201 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 DGUOKQ16854 277 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMAT1Q5H9K5 638 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 RPRMLQ8N4K4 120 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF676Q8N7Q3 588 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 DACH2Q96NX9 599 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ15Q99712 375 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 MED18Q9BUE0 208 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF224Q9NZL3 707 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRG2O14669 202 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 SGCEO43556 437 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 CDRT1O95170 752 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 IL1AP01583 271 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PATE4P0C8F1 98 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PER3P56645 1201 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PAMR1Q6UXH9 720 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP3Q96NJ6 502 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 HDHD2Q9H0R4 259 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A096LPE4 126 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPZ6 126 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 SHISA3A0PJX4 238 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNGR3O43761 229 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 SDC2P34741 201 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKXP51817 358 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PSG4Q00888 419 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM27D1Q5T7N8 215 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZT83 130 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 DOLPP1Q86YN1 238 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 RDH10Q8IZV5 341 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1K1Q8NGR3 316 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PHYHIPQ92561 330 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 OR14A2Q96R54 314 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2H1Q9GZK4 316 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF879B4DU55 563 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC19A2O60779 497 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 CGAP01215 116 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 IL2RAP01589 272 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 EDN3P14138 238 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 ODF4Q2M2E3 257 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC36A2Q495M3 483 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD16Q6P6B7 361 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 BTLAQ7Z6A9 289 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 STARD4Q96DR4 205 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT5BQ9H1J7 359 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 MOB1AQ9H8S9 216 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6C6A6NF89 314 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 DOK2O60496 412 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ISG15P05161 165 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 UCHL1P09936 223 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CALRP27797 417 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CX3CR1P49238 355 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ECH1Q13011 328 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 Q499Y3 187 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL2L15Q5TBC7 163 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF774Q6NX45 483 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 C3P1Q6ZMU1 363 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ELMOD2Q8IZ81 293 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 NAXEQ8NCW5 288 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10AC1Q8NH08 325 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR148Q8TDV2 347 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PBOV1Q9GZY1 135 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 BRD7Q9NPI1 651 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CRYGSP22914 178 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1-2P23083 117 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEB1P43366 347 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MTNR1BP49286 362 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GALK2Q01415 458 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MXD1Q05195 221 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS45Q7RTY3 260 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF283Q8N7M2 679 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1F12Q8NHA8 337 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 AKR7LQ8NHP1 331 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms