RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1W2PPR1	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	GJE1	A6NN92	205 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CTDSP2	O14595	271 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	UPK3A	O75631	287 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SC5D	O75845	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SULT1C4	O75897	302 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ACTL6A	O96019	429 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	KRT8	P05787	483 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SPARC	P09486	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	TACSTD2	P09758	323 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	S100A5	P33763	92 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	H3F3A	P84243	136 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	EGR3	Q06889	387 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	MEP1B	Q16820	701 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM225	Q6GV28	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	LUZP2	Q86TE4	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	GPAT4	Q86UL3	456 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	THEM6	Q8WUY1	208 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	MDFI	Q99750	246 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	TPK1	Q9H3S4	243 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PALMD	Q9NP74	551 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	FBN3	Q75N90	2809 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC35F4	A4IF30	521 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	TNFSF11	O14788	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	MPZL1	O95297	269 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PGA4	P0DJD7	388 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PGA3	P0DJD8	388 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CPN1	P15169	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF43	P17038	809 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	MTNR1B	P49286	362 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CAV3	P56539	151 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CLRN1	P58418	232 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	GLO1	Q04760	184 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	FOXF2	Q12947	444 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CAMK2D	Q13557	499 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	LIPN	Q5VXI9	398 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	OR6X1	Q8NH79	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SFXN2	Q96NB2	322 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	RBP7	Q96R05	134 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	OR8B4	Q96RC9	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	PIGM	Q9H3S5	423 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1B0GVG6	124 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364		H7C1Q1	480 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	DNPH1	O43598	174 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	GPRIN2	O60269	458 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	NCR1	O76036	304 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	SERPINA3	P01011	423 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	IGHG1	P01857	330 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ETV6	P41212	452 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	STAR	P49675	285 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CLDN17	P56750	224 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	CLDN20	P56880	219 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
RUBCN-208	ENST00000471364	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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