RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412585.6

HLA-B-249, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HLA-B, Length 1,547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-249ENST00000412585 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SLC22A4Q9H015 551 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 H7C1C5 153 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 TMCC2O75069 709 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 GYPBP06028 91 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 CHRNB4P30926 498 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 OR12D2P58182 307 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 LCN6P62502 163 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF544Q6NX49 715 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ABHD4Q8TB40 342 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 STARD4Q96DR4 205 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 KCNJ15Q99712 375 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SYT4Q9H2B2 425 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 GLTPQ9NZD2 209 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SMIM30A4D0T7 59 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 NCR1O76036 304 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 IGHV3-9P01782 118 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 FAM157BP0CG42 384 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 NTF4P34130 210 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 CDK5R1Q15078 307 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 CCDC58Q4VC31 144 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 THEM4Q5T1C6 240 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ARL9Q6T311 187 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 TMEM54Q969K7 222 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 MALT1Q9UDY8 824 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 PRSS50Q9UI38 385 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 J3QLW9 94 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 MSTNO14793 375 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 UPK3AO75631 287 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 GLCEO94923 617 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF19P17023 458 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SPI1P17947 270 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 CRABP1P29762 137 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 FAPQ12884 760 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 PYDC2Q56P42 97 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 BEND4Q6ZU67 534 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 OR2T4Q8NH00 348 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 PHYHIPQ92561 330 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SMIM19Q96E16 107 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 PELI1Q96FA3 418 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-249ENST00000412585 SERPINA3P01011 423 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 QDPRP09417 244 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF84P51523 738 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 FMODQ06828 376 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 P2RY14Q15391 338 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 HIST3H3Q16695 136 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 Q6ZT83 130 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 MCHR2Q969V1 340 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 CRLF2Q9HC73 371 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 FKBP7Q9Y680 259 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 SLC16A7O60669 478 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 CGAP01215 116 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 UCHL1P09936 223 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 ELK1P19419 428 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-249ENST00000412585 NPR2P20594 1047 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms