RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486862.1

OPTN-211, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 423 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-211ENST00000486862 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.51□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.51□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 MED12LQ86YW9 2145 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 CACNA1GO43497 2377 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ACOD1A6NK06 481 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TMEM212A6NML5 194 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 RER1O15258 196 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 KRT33AO76009 404 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ZFPL1O95159 310 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 FARS2O95363 451 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 PNPP00491 289 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 MPGP29372 298 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TIMP3P35625 211 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TGFBR1P36897 503 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 KIR3DL2P43630 455 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 SERPINB10P48595 397 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 PCBD1P61457 104 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 SCRN3Q0VDG4 424 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 LSAMPQ13449 338 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 DGUOKQ16854 277 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 WDR38Q5JTN6 314 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 C22orf42Q6IC83 251 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ZNF813Q6ZN06 617 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 SPATC1Q76KD6 591 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 SKA3Q8IX90 412 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 HTRA1Q92743 480 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 BOD1Q96IK1 185 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 KCNJ15Q99712 375 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 CENPMQ9NSP4 180 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 FAM206AQ9NX38 181 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 PRSS50Q9UI38 385 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.5□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 GTF3C1Q12789 2109 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 DOCK7Q96N67 2140 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TOXO94900 526 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 IL1AP01583 271 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 IGHV3-9P01782 118 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ISG15P05161 165 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TPOP07202 933 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ITGA5P08648 1049 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 UCHL1P09936 223 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 EDN3P14138 238 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 B4GALT1P15291 398 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 FAPQ12884 760 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ECH1Q13011 328 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 RAB35Q15286 201 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 CD163Q86VB7 1156 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 LRRC18Q8N456 261 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 OR5AK2Q8NH90 309 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 THRSPQ92748 146 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 SH3GL3Q99963 347 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 C12orf49Q9H741 205 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ASF1BQ9NVP2 202 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.49□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.48□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 OR6C6A6NF89 314 aa9.48□□□□□ -0.89
OPTN-211ENST00000486862 SYNGR3O43761 229 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms