RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	PMS2P2	O95744	297 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	HRG	P04196	525 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PSMB10	P40306	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CENPA	P49450	140 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RORC	P51449	518 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	BLVRA	P53004	296 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	BID	P55957	195 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC3A1	Q07837	685 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	INSL4	Q14641	139 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	TOMM20	Q15388	145 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	TRAM1	Q15629	374 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ETFDH	Q16134	617 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	UEVLD	Q8IX04	471 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	KLHL15	Q96M94	604 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	OXGR1	Q96P68	337 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	GALNT8	Q9NY28	637 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	AQP7P3	A6NL99	342 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CASK	O14936	926 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RAMP1	O60894	148 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	LY6G6D	O95868	133 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	HLA-DQA2	P01906	255 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CD1A	P06126	327 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ALOX5AP	P20292	161 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	EDNRA	P25101	427 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CRABP1	P29762	137 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SDC2	P34741	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RAC1	P63000	192 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SIRPA	P78324	504 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	MXD1	Q05195	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	FMOD	Q06828	376 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	POU4F3	Q15319	338 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RTTN	Q86VV8	2226 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	DSCAM	O60469	2012 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A0J9YW62	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SHISA3	A0PJX4	238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PSMD9	O00233	223 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PHYH	O14832	338 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SMPD2	O60906	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ABHD16A	O95870	558 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	TGM4	P49221	684 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364		Q5PR19	223 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	OTP	Q5XKR4	325 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	ABHD4	Q8TB40	342 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	GHSR	Q92847	366 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	PIGT	Q969N2	578 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	AMELY	Q99218	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RUBCN-208	ENST00000471364	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62

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