RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 P2RX4Q99571 388 aa10.68□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.68□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.68□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 KLHL14Q9P2G3 628 aa10.68□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 RNF7Q9UBF6 113 aa10.68□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa10.68□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 CAPN7Q9Y6W3 813 aa10.68□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 PKHD1P08F94 4074 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 OOEPA6NGQ2 149 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 NUDT19A8MXV4 375 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 IFNA6P05013 189 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 RAC2P15153 192 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 CLRN1P58418 232 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SYPL1Q16563 259 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 GALNTL6Q49A17 601 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 RABL3Q5HYI8 236 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SLC22A9Q8IVM8 553 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ANKFN1Q8N957 763 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 MCHR2Q969V1 340 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 COQ8BQ96D53 544 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 L3HYPDHQ96EM0 354 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 COG8Q96MW5 612 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 OR2H1Q9GZK4 316 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ABCB10Q9NRK6 738 aa10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 A6NDX4 124 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 H3BQF6 201 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 PLPP3O14495 311 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 MLNRO43193 412 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 OR6A2O95222 327 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SERPINE1P05121 402 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 PGA4P0DJD7 388 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 PGA3P0DJD8 388 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ADORA3P0DMS8 318 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 NEFHP12036 1026 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SLC6A1P30531 599 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 MAGEA12P43365 314 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 RAB13P51153 203 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 PRKAA2P54646 552 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 BLMHQ13867 455 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SELPLGQ14242 412 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 LIN52Q52LA3 116 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 FGFRL1Q8N441 504 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 C10orf53Q8N6V4 93 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 CLDN22Q8N7P3 220 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 CCNYL1Q8N7R7 359 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 OR2T11Q8NH01 316 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 RPS4Y2Q8TD47 263 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC115Q96NT0 180 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 DUSP26Q9BV47 211 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 WNT5BQ9H1J7 359 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 GSTO2Q9H4Y5 243 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SCOCQ9UIL1 159 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SNX24Q9Y343 169 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 STARD10Q9Y365 291 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 VGLL3A8MV65 326 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 IGHG1P01857 330 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ETFAP13804 333 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ECHS1P30084 290 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 CDAP32320 146 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 MAGEA4P43358 317 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ERVFRD-1P60508 538 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ECH1Q13011 328 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 NFYCQ13952 458 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 MELKQ14680 651 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SGCAQ16586 387 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 OR2T2Q6IF00 324 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SERPINA11Q86U17 422 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 CLECL1Q8IZS7 167 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 OR4A15Q8NGL6 344 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 OR5M8Q8NGP6 311 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 OR6S1Q8NH40 331 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 OR52P1PQ8NH57 321 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ITCHQ96J02 903 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 EPYCQ99645 322 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 ECSITQ9BQ95 431 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 SPATA25Q9BR10 227 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 C12orf10Q9HB07 376 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM100Q9NV29 134 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-211ENST00000463372 M0R1W7 72 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-211ENST00000463372 HMGN4O00479 90 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-211ENST00000463372 GLCEO94923 617 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms