RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN25C9JDP6 229 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PDCD5O14737 125 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CASKO14936 926 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MPZL1O95297 269 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GPANK1O95872 356 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ITGB2P05107 769 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CST2P09228 141 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SFTPCP11686 197 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ETV6P41212 452 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SELENOPP49908 381 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PSMD7P51665 324 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RIPPLY3P57055 190 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PCBD1P61457 104 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF45Q02386 682 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TLE1Q04724 770 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SRYQ05066 204 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ECH1Q13011 328 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF846Q147U1 533 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 Q499Y3 187 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MZT2AQ6P582 158 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF627Q7L945 461 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SIAH3Q8IW03 269 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GPR148Q8TDV2 347 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 BORCS5Q969J3 196 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ITFG2Q969R8 447 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MRI1Q9BV20 369 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 POLR1DQ9Y2S0 133 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LRP12Q9Y561 859 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.65□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 NCKAP5O14513 1909 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CD8B2A6NJW9 211 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ZFPL1O95159 310 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF12P17014 697 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CD40LGP29965 261 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SDC2P34741 201 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 PTGER4P35408 488 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TGFBR1P36897 503 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 PSMB10P40306 273 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 PEX19P40855 299 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SGCAQ16586 387 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 RPTNQ6XPR3 784 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ABHD3Q8WU67 409 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 NABP1Q96AH0 204 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 WDFY2Q96P53 400 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 AMELYQ99218 206 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SLITRK2Q9H156 845 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SP140LQ9H930 580 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CALHM2Q9HA72 323 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 GPR35Q9HC97 309 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 FBN2P35556 2912 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CACNA1DQ01668 2161 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A20A6NK97 555 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 TTLL8A6PVC2 850 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-202ENST00000409024 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.63□□□□□ -1.03
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