RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R233	179 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A10	O95528	541 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TACSTD2	P09758	323 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	DAO	P14920	347 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FXYD6P3	P58550	94 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PCBD1	P61457	104 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB39A	Q14964	217 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MEST	Q5EB52	335 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM27B	Q5VT28	67 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT80	Q6KB66	452 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	HTRA1	Q92743	480 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX18	Q96RF0	628 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RERGL	Q9H628	205 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PPL8	197 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC16A7	O60669	478 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ICMT	O60725	284 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OSM	P13725	252 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF250	P15622	560 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKACG	P22612	351 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	POU1F1	P28069	291 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPA	P49450	140 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FMOD	Q06828	376 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM209A	Q5JX71	171 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LEG1	Q6P5S2	330 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT9	Q86SS6	491 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4K13	Q8NH42	304 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf159	Q96HA4	380 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NTN4	Q9HB63	628 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		14.85	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		H7C1C5	153 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX14	O95416	240 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ADRA2A	P08913	450 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM157C	P0CG43	387 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBG1	P23258	451 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM33	P57088	247 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LCN6	P62502	163 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RIN1	Q13671	783 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC36A3	Q495N2	470 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LNX2	Q8N448	690 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC18	Q8N456	261 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3GL3	Q99963	347 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT4	Q9H2B2	425 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH20	Q9HBT6	801 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT84	Q9NSB2	600 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		14.84	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BSA7	217 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BHLHE40	O14503	412 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LY6H	O94772	140 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGN1	P05114	100 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CST2	P09228	141 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF3	P17036	446 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MSR1	P21757	451 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LAP3	P28838	519 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CHN2	P52757	468 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	UCP2	P55851	309 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM166A	Q6J272	317 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		14.83	□□□□□ -0.04

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