RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHD9Q3L8U1 2897 aa0.16□□□□□ -2.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 THADAQ6YHU6 1953 aa0.15□□□□□ -2.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa0.15□□□□□ -2.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.15□□□□□ -2.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 LAMA3Q16787 3333 aa0.15□□□□□ -2.38
CACNA2D1-211ENST00000486539 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A087WZY1 265 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM47DPA6NHR8 397 aa0.15□□□□□ -2.39
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CACNA2D1-211ENST00000486539 CLDN3O15551 220 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHST10O43529 356 aa0.15□□□□□ -2.39
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CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF250P15622 560 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 NTF3P20783 257 aa0.15□□□□□ -2.39
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CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXW4P57775 412 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCGB2A2Q13296 93 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 SELPLGQ14242 412 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 STUMQ69YW2 141 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRSS54Q6PEW0 395 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC65Q8IXS2 484 aa0.15□□□□□ -2.39
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CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC75AQ8NAA5 344 aa0.15□□□□□ -2.39
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CACNA2D1-211ENST00000486539 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 NTAN1Q96AB6 310 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIK3IP1Q96FE7 263 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED8Q96G25 268 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFP3Q96NJ6 502 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM111AQ96PZ2 611 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR8B4Q96RC9 309 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 RSG1Q9BU20 258 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00574Q9H8X3 128 aa0.15□□□□□ -2.39
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ELOVL3Q9HB03 270 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 NINJ2Q9NZG7 142 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL37Q9NZH6 218 aa0.15□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 LAMP5Q9UJQ1 280 aa0.15□□□□□ -2.39
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CACNA2D1-211ENST00000486539 SZT2Q5T011 3432 aa0.15□□□□□ -2.39
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CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLV7-43P04211 117 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 C2P06681 752 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 HEXBP07686 556 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF35P13682 527 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP2F1P24903 491 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 LOXP28300 417 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCR1P32246 355 aa0.14□□□□□ -2.39
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CACNA2D1-211ENST00000486539 GALR1P47211 349 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK16Q00536 496 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDH17Q12864 832 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLHL38Q2WGJ6 581 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPV17L2Q567V2 206 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 SOHLH1Q5JUK2 328 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF470Q6ECI4 717 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR10R2Q8NGX6 335 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAIP1Q8WWC4 291 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXorf40BQ96DE9 158 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 RARRES2Q99969 163 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 C21orf62Q9NYP8 219 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF492Q9P255 531 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 VANGL2Q9ULK5 521 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMED5Q9Y3A6 229 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA1671Q9BY89 1806 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 MUC3AQ02505 3323 aa0.14□□□□□ -2.39
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa0.14□□□□□ -2.39
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