RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ALG12Q9BV10 488 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 MSL2Q9HCI7 577 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 CACNG2Q9Y698 323 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 A0A087WUU8 490 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 CENPBD1B2RD01 187 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN25C9JDP6 229 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 FFAR1O14842 300 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 TCF21O43680 179 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 DOK2O60496 412 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 SLC16A7O60669 478 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 MPZL1O95297 269 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 SNAP29O95721 258 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 NGFP01138 241 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 GAAP10253 952 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF250P15622 560 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 MSR1P21757 451 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 PCMT1P22061 227 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 WNT5AP41221 380 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 HTR5AP47898 357 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 HIST3H3Q16695 136 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 ZBED5Q49AG3 693 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 FAM27BQ5VT28 67 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 GLYATQ6IB77 296 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 ARL9Q6T311 187 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 CBLL1Q75N03 491 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 OR51F2Q8NH61 342 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 RAB1CQ92928 201 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 NABP1Q96AH0 204 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM186Q96B77 213 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 RASD2Q96D21 266 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 C4orf45Q96LM5 186 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 GAL3ST1Q99999 423 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 CDC42EP2O14613 210 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 SLC22A2O15244 555 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 MGRN1O60291 552 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV1-46P01743 117 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 HLA-DQA2P01906 255 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 TFP02787 698 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 MSMBP08118 114 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 CD14P08571 375 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 CST2P09228 141 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 SBK2P0C263 348 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 ITGA2P17301 1181 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 SPIBQ01892 262 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 NRN1LQ496H8 165 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 OR5AS1Q8N127 324 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 FNDC8Q8TC99 324 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 SLC7A6Q92536 515 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 RAB39BQ96DA2 213 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-209ENST00000480420 SYT4Q9H2B2 425 aa6.88□□□□□ -1.31
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