RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 HOGA1Q86XE5 327 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 CMTM8Q8IZV2 173 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 KDM8Q8N371 416 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 OR4K13Q8NH42 304 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 WNT2BQ93097 391 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 S100A13Q99584 98 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 MICU1Q9BPX6 476 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 LHX6Q9UPM6 363 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PCNTO95613 3336 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 MEGF11A6BM72 1044 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 H0YIZ8 118 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ALOX12BO75342 701 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 NKX2-2O95096 273 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 F10P00742 488 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PET100P0DJ07 73 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 CPT2P23786 658 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PSMB5P28074 263 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 KIR3DL2P43630 455 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 LPAR6P43657 344 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 GATMP50440 423 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RAB28P51157 221 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZNF141Q15928 474 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ASB16Q96NS5 453 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-208ENST00000441439 A0A087WUJ7 227 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 A0A1W2PPC1 479 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 ZNF217O75362 1048 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 CST4P01036 141 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 ALOX5APP20292 161 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 SLC26A5P58743 744 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 TMEM215Q68D42 235 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 ZNF550Q7Z398 422 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 TMED6Q8WW62 240 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 DCUN1D4Q92564 292 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 RAB7BQ96AH8 199 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 WDR76Q9H967 626 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.09□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 A0A087WWC5 75 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 GLOD5A6NK44 160 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 IFITM10A6NMD0 228 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 C9JQL5 133 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 RHOP08100 348 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 THBS4P35443 961 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 ROM1Q03395 351 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 PMPCAQ10713 525 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 OR8G5Q8NG78 346 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 TMEM106AQ96A25 262 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 IGSF21Q96ID5 467 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 NEU1Q99519 415 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 PDE7BQ9NP56 450 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 IFNA2P01563 188 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 SNCAP37840 140 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 GPR1P46091 355 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 CLDN2P57739 230 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 IL13RA1P78552 427 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 ACTBL2Q562R1 376 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 AWAT1Q58HT5 328 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 PYY3Q5JQD4 70 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 LRRC18Q8N456 261 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 POC1AQ8NBT0 407 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-208ENST00000441439 OR5R1Q8NH85 324 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms