RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42EP2O14613 210 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SYNGR3O43761 229 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IDH3BO43837 385 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FKBP6O75344 327 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CRLF1O75462 422 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SNAP29O95721 258 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CD14P08571 375 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ADRA2AP08913 450 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FAM157BP0CG42 384 aa6.59□□□□□ -1.35
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SGMS1-201ENST00000361543 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FASP25445 335 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A6P31641 620 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CDAP32320 146 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NR4A2P43354 598 aa6.59□□□□□ -1.35
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SGMS1-201ENST00000361543 CTXN1P60606 82 aa6.59□□□□□ -1.35
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SGMS1-201ENST00000361543 PLP2Q04941 152 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN31Q12999 210 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FHL1Q13642 323 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GGTLC2Q14390 218 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MSMPQ1L6U9 139 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MICAQ29983 383 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 THEM4Q5T1C6 240 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ADCK1Q86TW2 530 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR51A7Q8NH64 312 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF519Q8TB69 540 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FANK1Q8TC84 345 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NSMAFQ92636 917 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NABP1Q96AH0 204 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RBP7Q96R05 134 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MDFIQ99750 246 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SYT3Q9BQG1 590 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FUZQ9BT04 418 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR51B6Q9H340 312 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TPK1Q9H3S4 243 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SIAEQ9HAT2 523 aa6.59□□□□□ -1.35
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SGMS1-201ENST00000361543 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.59□□□□□ -1.35
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SGMS1-201ENST00000361543 FZR1Q9UM11 496 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 AP4S1Q9Y587 144 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.59□□□□□ -1.35
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPW3 197 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 H7C1C5 153 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IMPA2O14732 288 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 DIRAS1O95057 198 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PTHP01270 115 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ANXA8P13928 327 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF32P17041 273 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GIFP27352 417 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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SGMS1-201ENST00000361543 ALDH3B1P43353 468 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OMPP47874 163 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LIMS1P48059 325 aa6.58□□□□□ -1.36
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SGMS1-201ENST00000361543 ACTR3P61158 418 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LCN6P62502 163 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK-25P63136 954 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RELBQ01201 579 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SGCAQ16586 387 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LRP11Q86VZ4 500 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.58□□□□□ -1.36
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