RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 PIRTP0C851 137 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PSMB10P40306 273 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HMGA2P52926 109 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 RPE65Q16518 533 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PHYHD1Q5SRE7 291 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB123Q8N688 67 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR2AE1Q8NHA4 323 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 C4orf36Q96KX1 117 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR1F2PQ96R84 312 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HBEGFQ99075 208 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 SCGB1D1O95968 90 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF728P0DKX0 622 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CD8BP10966 210 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 C6P13671 934 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CPMP14384 443 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FNTBP49356 437 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF154Q13106 437 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 BET1LQ9NYM9 111 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 LINC01553A4QN01 128 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 H7BYZ3 331 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 PPP1CBP62140 327 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 LRP11Q86VZ4 500 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 KCNK15Q9H427 330 aa4.51□□□□□ -1.69
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